در سال 1375 با پیگیری مداوم و مستمر، مصوبه شورای گسترش دانشگاههای علوم پزشکی در وزارت بهداشت را برای «اولین مرکز پژوهشی مستقل گوارش و کبد در ایران» دریافت کرد و در سال 1377 با حمایت و مساعدت ویژه نمایندگان مجلس شورای اسلامی ، ردیف مستقل بودجه به این مرکز اختصاص یافت. در سال 1390،  مرکز تحقیقات بیماریهای گوارش و کبد (DDRC)  به پژوهشکده بیماری های گوارش و کبد (DDRI) ارتقاء یافت.

این پژوهشکده هم اکنون دارای چهار مرکز تحقیقاتی شامل «مرکز تحقیقات بیماری های گوارش»، «مرکز تحقیقات بیماری های کبد، لوزالمعده و مجاری صفراوی»،  «مرکز تحقیقات سرطانهای گوارش و کبد» و «مرکز تحقیقات درمان های سلولی در بیماری های گوارشی» است.

چشم انداز

 - تبدیل شدن به معتبرترین و کارآمدترین مرکز پژوهشی کشور و خاورمیانه و ورود به فهرست 100 مرکز پژوهشی برتر دنیا در افق 1400

 اهداف

     اهداف پژوهشی:

- تولید و انتشار دانش پزشکی با کیفیت بالا و ترجمه دانش به راهبردهای عملی

-ایجاد بستری قوی برای پژوهش در زمینه بیماری های دستگاه گوارش با ظرفیت سازی و گسترش زیرساختها

- بهینه سازی پژوهشها و خدمات بالینی و تضمین کیفیت و روزآمد کردن خدمات بالینی بر مبنای اولویت های بهداشتی کشور

- تبدیل نتایج پژوهش ها به فناوری به منظور ارتقای فناوری سلامت بخصوص با تولید محصولات دارویی در دسترس و ارزان

     اهداف آموزشی:

- بهبود آموزش پزشکی بویژه در سطح فوق تخصصی بیماری های گوارش و کبد

- فراهم کردن فرصت های آموزشی برای دانشجویان پزشکی، پژوهشگران، دانشجویان دکتری تخصصی و فارغ التحصیلان رشته های پزشکی

- ارتقای کیفیت دوره فوق تخصص گوارش و کبد برای تربیت بهینه متخصصان این رشته

-  ارتقای کمی آموزش دوره فوق تخصص گوارش و کبد برای تربیت دست کم 7 فلوی فوق تخصص در سال

- راه اندازی دوره فلوشیپ اندوسکوپی پیشرفته تشخیصی و درمانی با همکاری دانشگاه جرج تاون و موسسه میوکلینیک در ایالات متحده

- اجرای برنامه های مستمر بازآموزی با کیفیت بالا برای فارغ التحصیلان دوره تخصص گوارش و کبد، فلوهای این رشته، و دستیاران داخلی با همکاری انجمن متخصصان گوارش و کبد ایران

- ارتقای کیفیت آموزش در حیطه بیماری های گوارش و کبد برای دانشجویان پزشکی عمومی و دستیاران داخلی

- راه اندازی واحد بومی سازی و به کارگیری دانش روز در زمینه فعالیت پژوهشکده

-راه اندازی دوره  آموزش مهارتی و حرفه ای مراقبت های پرستاری بیماری های گوارش و کبد بزرگسالان

    اهداف درمانی:

   -انتشار اهم نتایج دانش تولید شده در حوزه بیماری ها از طریق شبکه رسانه ای با هدف  توسعه آگاهی های مرتبط با حوزه سلامت

   -ارائه خدمات تشخیصی و درمانی پیشرفته و با کیفیت در زمینه بیماری های گوارش و کبد

   - حفظ و ارتقای خدمات درمانی پژوهشکده که هم اکنون به عنوان شناخته شده ترین مرکز ارجاع در زمینه بیماری های گوارش و کبد کشور مطرح است

   - استفاده از محصولات دارویی و سایر لوازم پزشکی تولیدی در کشور در کارآزمایی های بالینی به منظور حمایت از صنعت دارویی و صنایع تجهیزات پزشکی داخلی

گرایش های پژوهشی:

    - سرطانهای دستگاه گوارش

   - بیماری های شایع دستگاه گوارش

    - بیماری های مزمن غیرواگیر

 محصولات

     محصولات آموزشی:

- آموزش بیش از 140 فوق تخصص گوارش و کبد در پژوهشکده که هم اکنون جزو اعضای هیأت علمی دانشگاه های علوم پزشکی کشور هستند

-  آموزش  حدود 25  فلو، در زمینه متدهای اندوسکوپی پیشرفته که در دانشگاه های تیپ یک علوم پزشکی کشور فعالیت دارند

- ایجاد دوره های آموزشی کوتاه مدت در حیطه بیماری های گوارشی کودکان و سایر دوره های کوتاه مدت برای متخصصان و فلوهای سایر دانشگاه ها و مراکز علمی کشور

- آموزش 30 دانشجوی دکتر تخصصی در حیطه پژوهش

- آموزش پرستاران در دوره های مهارتی و حرفه ای مراقبت های پرستاری در بیماری های گوارش و کبد بزرگسالان

     محصولات علمی :

- اجرای بزرگترین مطالعه کوهورت خاورمیانه و شمال آفریقا در شمال شرق ایران (گلستان) با دستاوردهای مهم بین المللی

- همکاری به عنوان ستاد مرکزی در اجرای مطالعه آینده نگر ملی 200 هزار نفری کوهورت پرشین در استانهای ایران با اهداف پیشگیری از بیماری های مزمن غیرواگیر در قالب 5 زیرمجموعه کوهورت نوزادان، نوجوانان ، بالغین، سالمندان و کارکنان

 - ایجاد سه پایگاه مهم تحقیقاتی شامل پایگاه تحقیقاتی در شمال شرق ایران ( کوهورت گلستان -کلینیک اترک)، پایگاه تحقیقاتی در استان اردبیل (کلینک ارس) و پایگاه تحقیقاتی  کوهورت پارس در والاشهر استان فارس

 - انتشار بیش از 1200مقاله علمی در معتبرترین مجلات علمی داخلی و بین المللی با فعالیت 20 گروه پژوهشی در زمینه 20 بیماری شایع گوارشی و کبدی

- اجرای بیش از 30 کارآزمایی بالینی و چاپ آنها در مجلات معتبر بین المللی

- اجرای بزرگترین کارآزمایی بالینی  «پلی پیل»  (Poly Pill) برای پیشگیری از بیماری های قلبی عروقی و سکته های قلبی و مغزی در سطح منطقه و جهان

- تولید دو محصول دارویی «سووداک» ( Sovodak ) برای درمان بیماری «هپاتیت سی» و «پلی پیل» (Poly Pill) برای پیشگیری و درمان بیماری های قلبی - عروقی  ، چربی خون و فشار خون ،

- انتخاب به عنوان بهترین مرکز تحقیقاتی در ارزشیابی مراکز تحقیقاتی کشور ، با  اختلاف قابل توجه نسبت به دومین مرکز تحقیقاتی برگزیده

- کسب مقام اول در ارزشیابی پژوهشکده های بالینی سال 1395 کشور بویژه از نظر استنادات در مقالات علمی

 همکاری های ملی و  بین المللی:

- گسترش همکاری های پژوهشکده با مراکز تحقیقاتی ملی، سازمان بهداشت جهانی، دانشگاه های بزرگ و معتبر جهان و موسسات معتبر بین المللی در زمینه تحقیقات سلامت .

این پژوهشکده تا کنون در 22 پروژه بزرگ بین المللی و 300 مقاله معتبر جهانی همکاری علمی و تحقیقاتی داشته است

- راه اندازی 10 شبکه پژوهشی ملی از طریق اجرای پروژه های پژوهشی  با همکاری سایر مراکز علمی و پزشکی در سطح کشور

- راه اندازی شبکه  بین مراکز تحقیقات گوارش و کبد و سایر مراکز تحقیقاتی در سطح کشور