مرکز تحقیقات گوارش، به عنوان اولین مرکز تحقیقاتی مصوب شورای گسترش دانشگاه های علوم پزشکی کشور در زمینه بیماری های گوارشی در سال 1372 تاسیس شد. این مرکز طیف وسیع بیماری های خوش خیم دستگاه گوارش از جمله آشالازی، سلیاک، ریفلاکس و ... را تحت پوشش قرار می دهد که هر یک دارای گروه های پژوهشی جهت بررسی علمی بیماری ها، شناخت آن ها و نیز کلان طرح های تحقیقاتی در پاسخ به سوالات مطرح در این زمینه از بیماری ها می باشند.